我所因开展课题工作的需要,拟委托具有高通量测序资质的单位:
(略)
一、资质要求
具有GB/T
(略)/ISO9001:2015的资质认证。
二、委托服务期限
委托合同生效且样本合格后,15个工作日内完成测序及质控分析,提供合格的质控报告后,以单宗计费方式:
(略)
三、委托内容
在服务期内承担本项目的测序相关工作,包括60个样品代谢组测序和40个样品的转录组测序,服务包括样品RNA的提取、文库构建、库检、illuminaPE150测序6G,并按要求出具测序数据的质控报告以及流程分析结果,并能提供个性化分析服务;要求出具转录组和代谢组进行关联分析结题报告;
(略)可进行线上操作分析。
分析内容需要涵盖:
1.数据质控:对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads的处理
2.比对分析:比对核糖体序列、参考基因组(或其他参考序列)
3.基因分析:
1)新基因鉴定
2)基因类型统计
3)基因覆盖度统计
4)测序饱和度分析
5)基因测序随机性分析
4.基因表达量统计(表达量计算,表达量丰度分布)
5.样本关系分析(基于表达量)
1)主成分分析(PCA)
2)相关性系数热图
6.组间差异分析
1)差异基因整体统计
2)差异比较火山图
3)差异基因聚类热图
4)差异基因GO富集分析
5)差异基因KEGG富集分析
6)差异基因DO富集分析
7)差异基因Reactome富集分析
7.
(略)络分析(PPI分析)
1)String
(略)络分析
2)网络图绘制
8.GSEA分析(GeneSetEnrichmentAnalysis)
9.趋势分析
10.InDel/SNP突变分析
11.基因可变剪切鉴定
12.针对本项目提供转录组与代谢组关联分析,以及提供个性化分析服务支持
四、最高限价
本次招标费用最高限价为
(略)。
五、评定办法
1.按照服务报价最低价中标原则确定受委托单位:
(略)
2.请有意向单位:
(略)
联系人:
(略)
传真:
(略)邮箱:
(略)
单位:
(略)
单位:
(略)
邮政编码:351100
关注微信公众号 免费查看免费推送
|
上文为隐藏信息仅对会员开放,请您登录会员账号后查看, 如果您还不是会员,请点击免费注册会员
【咨询客服】 |
孟娟 |
![](/upload/replace/2024-07-05/20240705091533_1elIoF.jpg) |
【联系电话】 |
19720413970 |
【客服微信】 |
19720413970 |
|